牛奶过敏的诊断是富有挑战性的，牛奶过敏的症状往往没有特异性，特异性症状即指有该症状出现即可确诊为某疾病。皮肤点刺试验、血清过敏原检测只评估IgE的水平，而50%以上的牛奶过敏是非IgE介导的，目前缺乏可信赖的检测方法。这也可以解释，为什么有些临床医生怀疑宝宝为牛奶过敏，查过敏原检测却显示正常。

诊断牛奶过敏原的金标准为：食物回避试验2～4周+开放性食物激发试验。严格回避牛奶及其奶制品2～4周，如果过敏症状缓解；恢复全牛奶蛋白配方，症状复现，即明确诊断牛奶过敏。回避期间推荐食用氨基酸配方粉。

注意：开放性食物激发试验由于存在一定的严重过敏反应的风险性，且操作流程复杂、建议只应用于少数条件完备的过敏诊断中心；如果IgE检验已为阳性，则无需进行食物开放性激发试验即可诊断。