病原：乙型链球菌为主要致病菌。非溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎双球菌、流感杆菌及腺病毒等也可以引起本病。细菌和病毒混合感染者也较多见。近年来，还发现有厌氧菌感染的病例。 上述病原体通常存在于正常人的口腔及扁桃体内而不会致病，当某些因素使全身或局部的抵抗力降低时，病原体则“乘虚而入”侵入体内，或于此时因为原有细菌大量繁殖也可致病。而受凉、潮湿、疲劳过度、吸入有毒气体如一氧化碳(CO)等均可为诱因。

病因：营养不良、佝偻病、消化不良、平时缺乏锻炼，以及有过敏体质的小儿，因身体防御能力减低，容易发生扁桃体炎，特别是有原发性免疫缺陷病或后天获得性免疫功能低下的患儿，抵御病原微生物的能力低下，就更容易患急性扁桃体炎。 小儿患扁桃体炎时全身的感染症状很明显，孩子表现为：高烧可达39～40℃，同时伴有寒战，全身乏力，头痛及全身痛，食欲不振，恶心和呕吐。检查咽部时可发现扁桃体上有脓。 扁桃体发炎的小儿会说自己的嗓子痛，咽东西痛，咽水也痛;如果让小儿张开嘴，压住舌头，就会看到咽部有两个红肿的小桃子样的扁桃体，有的还有可能有脓，如果肿大的比较厉害，会导致小儿呼吸困难，危及生命安全。